Dalam upaya untuk mencapai visi INDAF, maka misi yang dirumuskan adalah sebagai berikut:

1. Menyelenggarakan tridarma perguruan tinggi yang berkualitas dan Professional, melalui pendekatan kolaboratif yang sesuai dengan kebutuhan masyarakat luas;
2. Meningkatkan kualitas kompetensi sumber daya manusia yang kuat secara mental spiritual dan produktivitas intelektual;
3. Melaksanakan pengembangan nilai-nilai keilmuan yang positif baik secara akademik dan non akademik, dan memberikan layanan pengembangan potensi kemandirian lulusan;
4. Menerapkan sistem tata Kelola yang akuntabel dan mampu merealisasikannya dalam lingkungan internal dan eksternal secara tepat dan berkelanjutan; dan
5. Menyelenggarakan penelitian dan pengabdian dalam rangka pengembangan dan pemberdayaan masyarakat untuk menjadikan masyarakat yang madani, moderat, dan berilmu pengetahuan.